Versions Compared

Key

  • This line was added.
  • This line was removed.
  • Formatting was changed.
Excerpt
Section
Column
width30%
Panel
borderColor#2A7886
titleColor#fff
borderWidth2
titleBGColor#2A7886

Purpose: Drug design, Molecular Dynamics
Latest version: 20182022-42
Licence: (warning) Must be provided by the user.
                 Proprietary License
Websitehttps://www.schrodinger.com/_ext-link

Column
width70%

Schrödinger is a suite of programs for drug design, bioinformatics and molecular dynamics.

Schrödinger is a highly modular suite of programs for a variety of simulation, design, visualisation, docking, modelling and bio/chemoinformatics purposes. Several distributions focus on drug design, materials science, biological systems and data treatment and visualisation, providing tools for pre- and post-processing, interfaces, analysis and optimisation for custom workflows between the programs and integrated environments. Schrödinger suites contain programs also available as stand-alone releases, such as Desmond or Jaguar.

Available modules:


  • Canvas: Entorn de treball enfocat a la quimioinformàtica.
  • ConfGen: Anàlisi conformacional de molècules.
  • Desmond: Dinàmiques moleculars d’alt rendiment.
  • Epik: Predicció dels estats de protonació del lligand mitjançant càlculs del pKa.
  • Glide: Docking lligand-receptor per virtual screening.
  • Jaguar: Modelització ab initio de molècules petites.
  • Jaguar pKa: Predicció de pKa en dissolució aquosa mitjançant mètodes ab initio.
  • LigPrep: Generació d'estructures 3D de lligands a partir de models 2D.
  • MacroModel: Modelització molecular (minimització, dinàmica, anàlisi conformacional...).
  • Phase: Generació de farmacòfors per ligand-based drug design.
  • Shape Screening: Eïna per a buscar similituds de manera ràpida i eficient. A fast and efficient tool for shape-based superposition and similarity searching.
  • Prime: Predicció d'estructura de proteïnes, permetent també generar models de receptor per structure-based drug design.
  • QikProp: Predicció de propietats ADME de candidats a fàrmacs.
  • QSite: Càlcul de mecanismes de reacció mitjançant metodologia QM/MM.
  • SiteMap: Identificació de centres actius de manera rápida i acurada.
  • Strike: Predicció de relacions estructura-activitat (QSAR).
  • OPLS3: Per a paràmetres precisos de camps de forces.
  • KNIME: Conjunt d’eines per a l'automatització de processos i d’anàlisi de dades.