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2023-1 Fecha de inicio: Fecha de finalización: |
¿Qué es la RES?
La Red Española de Supercomputación (RES) es una infraestructura distribuida que consiste en la interconexión de 12 supercomputadores con el objetivo de ofrecer recursos de computación de alto rendimiento a la comunidad científica (más información).
El uso de recursos para los proyectos que se engloban en el marco de la RES es diferente respecto al resto de proyectos. A continuación te detallamos qué recursos hay disponibles en el CSUC y cómo acceder a ellos.
La infraestructura de cálculo del CSUC
En el CSUC, los recursos asignados a proyectos de la RES están reservados y son de acceso exclusivo para sus usuarios.
Actualmente, hay disponibles dos máquinas diferentes de cálculo, PirineusII y Canigó.
| Canigó | PirineusII | |
|---|---|---|
| Modelo | Bull Sequana X800 | Bull Sequana X550 |
| Características | Máquina de memoria compartida | Clúster heterogéneo de alto rendimiento |
| Tipo de CPU | Intel Xeon Platinum 8168 2.70GHz | Intel Xeon Platinum 8168 2.70GHz |
| Núcleos por nodo | 192 | 48 |
| Núcleos para usuarios de la RES | 384 | 1152 |
| Memoria por núcleo | 24064 MB | 3900 MB |
| Interconexión | Infiniband 100GB | Infiniband 100GB |
| Sistema operativo | Red Hat Enterprise Linux | Red Hat Enterprise Linux |
Características de la infraestructura de cálculo disponible en el CSUC para los usuarios de la RES.
En nuestro portal de HPC se puede encontrar información más detallada sobre el software instalado en nuestras máquinas y algunos ejemplos.
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La ejecución de los trabajos
Para la administración de los trabajos, se usa el SLURM Workload Manager.
Debido a que los recursos de la RES son de uso exclusivo para sus usuarios, es necesario indicar explícitamente a SLURM qué cola y máquina de cálculo se quieren utilizar:
- La partición (cola): Se indica mediante -p o --partition y puede tener uno de los siguientes valores:
- class_a: Asigna la más alta prioridad a los trabajos. Normalmente es la cola principal a usar.
- class_b: Asigna una prioridad media a los trabajos.
- class_c: Asigna la prioridad más baja a los trabajos. Disponible durante 1 semana una vez finalizado el período.
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La cola y máquina a utilizar vienen determinadas por la asignación de los proyectos que hace la coordinación de la RES (más información). Una vez el periodo vigente de la RES finaliza, se deshabilitan el uso de las colas de más prioridad y se habilita la cola class_c durante 1 semana más para que se puedan ultimar los proyecto. Posteriormente se deshabilitan el acceso a todas las colas. A menos que el usuario renueve proyecto en nuestra infraestructura, los datos almacenados en su directorio /scratch/<user> y /home/<user> se eliminarán. |
Ejemplos
Cálculo de alta prioridad mediante la cola class_a
| Code Block | ||
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#!/bin/bash #SBATCH -J job_name #SBATCH -o std_out_file.out #SBATCH -e std_err_file.err #SBATCH -p class_a # Envío a la cola class_a #SBATCH -t 0-05:00 (...) |
Cálculo de baja prioridad mediante la cola class_c
| Code Block | ||
|---|---|---|
| ||
#!/bin/bash #SBATCH -J job_name #SBATCH -o std_out_file.out #SBATCH -e std_err_file.err #SBATCH -p class_c # Envío a la cola class_c #SBATCH -t 0-05:00 (...) |